Illumina Miseq是2011年2月推出的新一代小型化（bench-top）測(cè)序儀，這款儀器使用了Illumina TruSeq可逆中止堿基邊合成邊測(cè)序的化學(xué)方法，與HiSeq 2000相比，雖然每個(gè)Run的測(cè)序通量很低，但是久經(jīng)考驗(yàn)的新一代測(cè)序試劑帶來無可比擬的準(zhǔn)確性，結(jié)合上全新的流體系統(tǒng)，使得一個(gè)測(cè)序循環(huán)時(shí)間縮短了8倍以上。

??技術(shù)特點(diǎn)

??1、測(cè)序周期短：Miseq V2 150PE運(yùn)行時(shí)間短至24小時(shí)，可用于快速的擴(kuò)增子測(cè)序或小基因組測(cè)序，以極少的時(shí)間完成數(shù)據(jù)量需求較少的項(xiàng)目。

??2、Pair-end 讀長(zhǎng)達(dá)250bp：Miseq測(cè)序讀長(zhǎng)已經(jīng)達(dá)到2×250bp，可有效地跨越復(fù)雜基因組的高度重復(fù)區(qū)域，從而提高拼裝的效果，更有利于進(jìn)行基因注釋和基因功能的深入挖掘。

??3、測(cè)序流程便捷：小巧、一體化的MiSeq平臺(tái)整合了cluster生成，Pair-end測(cè)序和完整的數(shù)據(jù)分析，節(jié)省了實(shí)驗(yàn)室空間。通過直觀的觸摸屏界面開展簡(jiǎn)單的儀器操作，即插即用的試劑帶有RFID追蹤，具有自動(dòng)化的便利。

??測(cè)序流程

??應(yīng)用范圍

??1、擴(kuò)增子測(cè)序

??長(zhǎng)的末端配對(duì)讀取能力、速度與高數(shù)據(jù)質(zhì)量，使得擴(kuò)增子測(cè)序的項(xiàng)目可在幾天內(nèi)完成。

??2、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

??與454測(cè)序儀相比，長(zhǎng)度類似，價(jià)格便宜，便于實(shí)現(xiàn)De novo組裝，更的基因注釋。

??3、小基因組De novo組裝

??2×250bp讀長(zhǎng)與高達(dá)7G的測(cè)序通量，適合如微生物這類小基因組的項(xiàng)目，拼接效果好。

??4、微生物多樣性分析

??2×250bp讀長(zhǎng)，已經(jīng)可以測(cè)通一些可變區(qū)域，更有利于提高分析結(jié)果的準(zhǔn)確性。