硅藻土的主要礦物成分為蛋白石，并含有粘土（高嶺石類、水分母類及少量膠嶺石類）、炭質(zhì)（有機(jī)質(zhì)）、鐵質(zhì)（褐鐵礦、赤鐵礦、黃鐵礦）、碳酸鹽礦物（方解石、白云石、少量菱鐵礦）、石英、白云母、海綠石、長(zhǎng)石。
〈1〉蛋白石 Si02nH20
系標(biāo)準(zhǔn)的團(tuán)體水凝膠礦物，是含水二氧化硅凝膠脫部分水后形成，一般稱為含水膠體礦物或膠體礦物。
蛋白石中nH20表示含有不定量吸附水(自由水)型膠體水，膠體水不加入礦物晶格。膠體水作為分散媒散布于膠體粒子表面，含水量由1-5%，個(gè)別達(dá)34%。由于膠體水是膠體礦物固有特征，因此一般都計(jì)入礦物成分中。膠體水失水溫度一般在110℃-250℃，某地蛋白石測(cè)定吸熱反應(yīng)在65℃、115℃、360℃，而，的為115℃，在600℃也有部分失水反應(yīng)。
蛋白石硬度一般為5-5.5，當(dāng)水含量很少時(shí)，硬度增至6。
蛋白石本身無(wú)色，呈半透明狀的產(chǎn)生一種乳光，由于吸附帶色的雜質(zhì)及離子，使蛋白石呈顯各種色調(diào)。如鐵質(zhì)混染使蛋白石里黃褐、褐色，炭質(zhì)混染呈灰黑色。
上饒硅藻土價(jià)格表（上饒改性硅藻土）蛋白石常成致密塊狀、鐘乳狀、瘤狀團(tuán)塊、結(jié)核狀和球粒結(jié)構(gòu)及各類沉積巖中的次生充填物。當(dāng)?shù)鞍资撍瓣惢饔没驊?yīng)力作用，則產(chǎn)生電裂紋和角礫狀外貌，轉(zhuǎn)化為變膠體礦物石英、石髓，或蛋白石在偏光作用下顯示局部不均一的非均質(zhì)性。
蛋白石在光線照射下，轉(zhuǎn)動(dòng)礦物，表面出現(xiàn)微藍(lán)、白、淺紅色交替變化的變彩。 蛋白石在X衍射分析中無(wú)譜線反應(yīng)，但由于二氧化硅凝膠轉(zhuǎn)變?yōu)榈鞍走^(guò)程中，有微量方英石晶出，因此具有方英石譜線反應(yīng)。
在地質(zhì)歷史中，大量膠態(tài)氧化硅沉積在古生代地層中，特別是前寒武紀(jì)，受到變晶作用影響而轉(zhuǎn)變?yōu)樽兡z態(tài)的石英、石髓質(zhì)巖石，如碧玉巖、石英巖、石英片巖。凝膠態(tài)的蛋白石組成的沉積巖層，只能在第三紀(jì)、第四紀(jì)地層中及少部分中生代地層中得以保留。硅藻土產(chǎn)出的地層如山東臨朐、滇西地區(qū)均產(chǎn)于第三系中新統(tǒng)。